Існують і міжмолекулярні взаємодії, наприклад водневий зв'язок. Вона виникає при взаємодії атома водню, з'єднаного з електроноакцепторними атомами `("N"`, `"O"`, `"F")` і не поділеною електронною парою іншого атома або іншої молекули.

Ще раз чіткіше сформулюємо, чому водневий зв'язок утворюється: На атомі водню зосереджено частковий позитивний заряд. На атомі F, O чи N зосереджено частковий негативний заряд. Атоми F, O і N мають неподілені електронні пари, на яких сконцентрована електронна щільність.

Водневий зв'язок між молекулами води Завдяки своїй полярній природі молекули води добре притягуються один до одного. Позитивно заряджений кінець однієї молекули – атом водню – притягується до негативно зарядженого кінця іншого молекули – До атома кисню.

Водневі зв'язки характерні таких речовин, як вода H2O, аміак NH3, фтороводород HF. У водних розчинах аміаку або HF ці молекули утворюють водневі зв'язки як між собою, а й з молекулами води.