Загалом, найкращий час для структурної обрізки бонсай – рання весна або пізня осінь (до початку вегетаційного періоду або після нього). Це питання можна уточнити в розділі про види дерев. Наприклад, час обрізки фікуса відрізняється від часу обрізки ялівцю.
Застосування дроту є найважливішим методом формування бонсай. Обмотавши гілки дерева дротом, можна зігнути їх і надати їм потрібної форми і положення. Пройде кілька місяців, перш ніж гілки “запам’ятають” нову форму; після цього дріт можна зняти.
Для листяних бонсай рекомендується починати обкручування дротом навесні в п’ять-шість місяців. Хвойні бонсай обкручують дротом після видалення пагонів і знімають його найпізніше через десять місяців. Вічнозелені дерева обмотують дротом навесні і влітку на один місяць.