Крім того, Вавилон зник через брехню його, через фальшивих ідолів його, звірів і сов, яким він продовжує поклонятися. А пророк Ісайя прорік: І Вавилон, краса царств, гордість Халдеїв, буде повалений Богом, як Содом і Гоморра (Іс. 13:19). Сталося те, що було передбачено.
Близько 1223 року до н. е. Тукульті-Нінурта I захопив Вавилон ; стіни міста було зруйновано, частину жителів страчено або викрадено в рабство, храми пограбовано (зокрема вивезено ідола Мардука), а царя викрали в полон.
Починаючи з III століття до нашої ери Вавилон поступово занепав. Вавилон частенько ставав здобиччю різних завойовників. У 539 році до нашої ери ним оволодів перський цар Кір II, і місто стало однією зі столиць держави Ахеменідів.