Найбільш уразливі дрібні види і молоді особини, вони можуть страждати навіть від власних родичів, серед цих рептилій відомі випадки канібалізму. На варанів можуть нападати великі змії, хижі птахи, крокодили.

Для дорослого варана загрозу становить гребнистий крокодил і друзі-канібали. Варан здається дуже неповоротким, проте він може розганятися до 20 км/год, добре й охоче плаває. Людина шкодить варанам, знищуючи їхнє середовище існування, а разом з ним і їжу варанів – інших тварин.

Комодські варани – досить агресивні тварини, що становлять небезпеку для людини. Відомі випадки нападу цих хижаків на людей зі смертельними наслідками. Крім потужних щелеп небезпеку становлять і отруйні залози варана – під час укусу токсини можуть спричинити в жертви шок, параліч і втрату свідомості.