Озера мають здебільшого змішане походження. За переважною ознакою найпоширеніші тектонічні, льодовиково-тектонічні та льодовиково-акумулятивні типи озер. У Карелії найчастіше трапляються льодовиково-акумулятивні озера.

Улоговини більшості озер виникли внаслідок утворення тектонічних розломів у первинних породах земної кори, які потім були згладжені під час руху льодовика. Відповідно до напрямку руху льодовика, більшість озер мають форму витягнуту з північного заходу на південний схід.

Улоговини озер виникають унаслідок руху льодовиків, тектонічних рухів, у кратерах згаслих вулканів, під час загородження річок обвалами гірських порід тощо.

Основна причина великої кількості озер у Карелії та на Кольському півострові – рух льодовика, після якого в землі залишалися заглиблення і після танення льодовика вони заповнювалися водою.